La Institución Educativa San Agustín de Huánuco ha sido reconocida de manera continua por la Pontificia Universidad Católica del Perú (PUCP) como Colegio de Excelencia, en mérito al destacado desempeño académico de nuestros exalumnos durante su formación universitaria en dicha casa de estudios. Este reconocimiento permite que nuestros estudiantes de quinto de secundaria accedan a la modalidad especial de admisión denominada Ingreso por Tercio Superior (ITS), la cual se desarrolla anualmente en el mes de junio.